Ingénieur d'études en transcriptomique HF

Infinity est un institut de recherche interactif offrant un environnement scientifique productif et structuré centré sur trois axes disciplinaires : lImmunologie et les Maladies Infectieuses et Inflammatoires. Infinity est labellisé par lINSERM le CNRS et lUniversité Toulouse III. Linstitut se compose de 14 équipes de recherche de réputation internationale de 4 plateaux technologiques de pointe et de services supports efficaces (plus de 260 membres au total).

Dans le cadre de projets de recherche financés par lAgence Nationale de la Recherche (ANR) et le Conseil Européen de la Recherche (ERC) nous recrutons un.eingénieur.e détude expérimenté.epour contribuer au développement de projets en transcriptomique à haut débit et en transcriptomique spatiale.

La personne recrutée sera principalement impliquée dans lapréparation de librairies de scRNA-seq (10x Genomics)ainsi que dans lapréparation des lames pour les expériences de transcriptomique spatiale notamment avec la technologieXenium (10x Genomics).

Il/elle assurera également lacommunication et la coordination avec les plateformes de séquençage notamment pour lorganisation et le suivi des envois déchantillons la planification des séquençages et le suivi des résultats.

En étroite collaboration avec les chercheurs de léquipe lingénieur.e détude prendra en charge une part importante des expériences de transcriptomique depuis la préparation des échantillons et des librairies jusquà la mise en œuvre et à loptimisation des approches de transcriptomique spatiale. Il/elle contribuera également audéveloppement et à loptimisation des stratégies danalyse des données spatiales.

La personne recrutée participera par ailleurs à lanalyse linterprétation et la valorisation des données générées en sappuyant notamment sur les logiciels et environnementsR Python et Imaris.

Une expérience complémentaire engénotypage en imagerie par microscopie confocale ou en digestion et préparation de tissusconstituerait unatout apprécié notamment afin de pouvoir apporter ponctuellement un soutien aux différents projets et activités expérimentales de léquipe en fonction des besoins.

Par son expertise technique son autonomie et son interaction étroite avec les membres de léquipe lingénieur.e recruté.e occupera unrôle central dans le développement des approches technologiques et contribuera directement à lavancée des projets de recherche de léquipe.

Activités principales :

• Choisir et adapter les technologies danalyse et dexpérimentation en fonction des objectifs de recherche dans le cadre dune approche spécialisée (scRNAseq transcriptomique spatiale)
• Développer des techniques et des instruments adaptés à une approche méthodologique de la transcriptomique et imagerie confocale
• Former et assurer un transfert technologique
• Conseiller sur les possibilités techniques leurs limites les méthodes danalyse leur interprétation et en assurer le suivi
• Rédiger des rapports dexpériences ou détudes des notes techniques
• Concevoir et optimiser des expériences dans le cadre dun domaine détude de la biologie cellulaire et moléculaire (biologie de la peau immunologie principalement)
• Participer à la gestion des moyens techniques humains et financiers alloués
• Organiser et contrôler lutilisation collective de lappareillage et des postes de travail
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine dactivité et présentation des résultats en réunion déquipe ou de laboratoire
• Assurer lapplication des principes et des règles dhygiène et de sécurité

Savoir-faire :

• Solides connaissances pratiques en biologie moléculaires et biologie cellulaire. Des expériences sur les préparations de librairies scRNAseq est un atout
• Compétence dans les techniques de présentation orale
• Capacité à travailler en équipe
• Maitrise du pack office (Excel Word Powerpoint)

Aptitudes :

• Esprit déquipe
• Rigueur
• Esprit dinitiative
• Esprit de planification
• Contact facile